Известная нам история Экзара Куна начинается в 3997 году до Явинской Битвы. На тот момент Джедаи еще не так тесно связаны с властями Республики. Центры обучения находятся не только на Корусканте, но и на других планетах, в частности, на Оссусе. Нет еще глубокого запрета на привязанности. Джедаи влюбляются, женятся, заводят детей. Нет традиции выращивания падаванов с младенчества - многие начинают свои тренировки, будучи уже подростками.
Экзар Кун - пока еще молодой джедай, ученик Водо-Сиоск Баса. Но путь джедая не соответствует его личности, пускай даже сам он этого еще не осознал. Кун - яркий индивидуалист. Гордый, самолюбивый, со взрывным темпераментом. Он проявляет уважение разве что к наставнику, ни во что не ставя соучеников. Но вскоре и учитель теряет авторитет в глазах Экзара. Сначала - в духовном плане, когда отказывается ознакомить ученика с информацией о первых Темных Лордах Ситов. А потом и в воинском искусстве - когда в поединке Кун оказывается сильнее. Молодой человек считает, что Водо больше ничего не может ему дать - и уходит. Он полагает, что сам достоин титул мастера.
Экзар Кун отправляется на Ондерон - планету, где всего год назад было свержено правление адептов Темной Стороны. Находящимся на планете Джедаям - мастеру Арке Джету и его ученикам - он представляется ученым-археологом, специально прибывшим для изучения древних ситских артефактов. Но Арка отказывает ему в помощи. Экзару приходится действовать самостоятельно.
Он спасает от разъяренной толпы двух представителей бывшей правящей партии Ондерона. И таким образом находит себе проводников к гробнице Фридона Надда на Дксане (спутник Ондерона).
Вскрыв саркофаг, Экзар освобождает дух Фридона Надда. Тот делает ему коварный подарок - пару древних свитков, написанных Нагой Садоу. Их содержание манит Куна еще большими знаниями, и приводит на Коррибан, родную планету ситхов.
Где и попадает в ловушку. Он уже по-настоящему жалеет о принятом им решении, и хочет вернуться назад на корабль. Но дух Фридона Надда устраивает два каменных обвала. Они отрезают Куну дорогу к бегству, и перемалывают кости. Экзар обречен на медленную смерть. Призрак предлагает ему принять Темную Сторону и исцелиться. Нелегкий выбор для человека, искренне убежденного в том, что он - джедай. Но жажда жизни побеждает. Пускай он и заявляет, только оправившись: "Я никогда не буду принадлежать Темной Стороне!" Призрак лишь снисходительно улыбается - он-то знает, что Кун уже не может свернуть с темного пути.
Следующий пункт назначения Экзара - Явин IV. Мир, где Нага Садоу ставил свои эксперименты над массаси. Но со времен Садоу прошло немало времени. Когда-то воины, массаси одичали и деградировали. И только из поколения в поколение у них передавалась легенда, что однажды появится темный лорд, который вернет им прежнее величие..
Экзар Кун попадает к ним в плен - и его собираются принести в жертву местному чудовищу. Но жажда жизни побеждает снова - и Куну удается отобрать у жреца массаси амулет Наги Садоу. Артефакт многократно усилил темную энергию Куна - и позволил ему не только уничтожить чудовище, но и расправиться с духом Фридона Надда.
Массаси же увидели в Куне того самого темного лорда из своей легенды. С этого момента и впредь он стал их новым Повелителем, их живым божеством.
Позднее Кун покидает Явин, ставя перед собой задачу уничтожить Старую Республику. Рядом с ним находится его ученик - джедай-отступник Улик Кель-Дрома. Кун - идеологический лидер и хранитель знаний. Улик же - военный вождь, руководящий объединенной армией из тетанских сил и мандалорских кланов. Против этого мощного тандема - чуть ли не вся Галактика.
Кун вербует сторонников прямо из род носа джедайских мастеров, освобождает Кель-Дрому прямо из судилища на Корусканте - после того, как последний попадает в плен, разграбляет планету библиотек Оссус.
Фактически Экзару не нужен никто, кроме самого себя, он ни к кому не привязан. От ставит генетические эксперименты над массаси, отсылает на верную смерть преданных ему учеников.
Покидая Оссус, он спокойно оставляет там Улика Кель-Дрому. Тот дожжен сам о себе позаботиться. Но происходит непредвиденное. Улик убивает в поединке своего брата Кая, и подоспевшая к месту трагедии Номи Санрайдер навсегда блокирует ему доступ к Силе. Раздавленный несчастьем, он предает своего учителя, выдавая Джедаям местонахождение базы Экзара - Явин IV.
Джедаи кидают все свои многотысячные силы против единственного Темного Лорда. Но Экзар Кун больше не боится смерти. Подобно своим темным предшественникам, он собирается сохранить свой дух. Кун приковывает себя к фокусирующей точке пирамид, и вытягивает жизньиз преданных ему массаси. В то время как наступающая сверху армия джедаев задействует против него Стену Света. Свет сталкивается с Тьмой, пламя охватывает джунгли, звучат последние слова Экзара: "Мой дух будет жить вечно… Вечно!!!"
Но дух Куна оказывается навечно прикован к уцелевшим в огне пирамидам Явина…
И, спустя 4 тысячи лет, с ним сталкиваются первые ученики Люка Скайуокера. Призрак является им в видениях. Он приводит к гибели Ганториса, склоняет на Темную Сторону Кипа Даррана. Потом совершает несколько безуспешных покушений на самого Люка. 12 учеников Академии при поддержке духа бывшего учителя Куна - Водо-Сиоск Бааса, в конечном итоге уничтожают призрак Экзара.
Уничтожают ли? О, нет! Пускай так думают Джедаи. На самом деле они лишь освободили его из явинской ловушки. И Экзар Кун еще найдет способ вернуться в этот мир…